——应用研究面向重大现实问题，为党和政府的决策发挥了思想库和智囊团作用。2006年5月26日，在中共中央政治局第三十一次集体学习时，“知识产权制度变革与发展研究”的首席专家中南财经大学吴汉东教授，就国际知识产权保护和我国知识产权保护的法律和制度建设进行了专题讲解。国家知识产权战略制定小组委托吴汉东教授起草了《国家知识产权战略纲要》（专家建议稿）。以吉林大学宋冬林教授为首席专家的“东北老工业基地资源型城市发展接续产业问题研究”课题组，完成《关于实施“打包改制”带动东北地方国有企业制度创新走出困境的建议》一文，得到了中央及多个部委领导的重视，国家开发银行依据“打包改制”的思路，与吉林省人民政府签订了《加快吉林老工业基地振兴开发行金融合作协议》。中国人民大学曾湘泉教授主持的“全面建设小康社会进程中的我国就业发展战略”课题组向多个部委提交了多份研究报告，其中有关就业和失业测量体系设计思路和政策建议已被国家统计局吸收和采纳。“公共服务性政府构建研究”课题的首席专家南开大学朱光磊教授，2006年两次受到国务院有关领导约请，就“目前在进一步转变政府职能过程中面临的主要任务和对策”、“政府机构设置、编制和行政区划改革等问题”汇报研究成果。北京师范大学“处境不利儿童心理发展状况与教育对策研究”课题组调查访问了北京、辽宁、河南等地的3000余名儿童，提交的论文和报告产生了较高的学术和社会影响。